Bolo to v Los Angeles v roku 1983, keď sa na gymnáziu Fairfax stretol Anthony Kiedis, Michael Balzary (tiež známy ako Flea), Hillel Slovak a Jack Irons, aby založili rockovú kapelu. Pôvodne sa volala Tony Flow and the Miraculously Majestic Masters of Mayhem (šťastie, že sa premenovali) a prvý koncert odohrali v miestnom losangeleskom striptízovom bare. Hoci mala vtedy kapela iba jednu vlastnú pieseň, úspech zožala aj tak. Hudobníci posilnení LSD a inšpirovaní všadeprítomnými striptérkami sa rozhodli odohrať svoj set úplne nahí, s ponožkou na svojom pohlaví. S týmto výstrelkom sa ľahko dostali do povedomia ľudí, čo im umožnilo koncertovať v najrôznejších hudobných kluboch. Netrvalo dlho a nahrávacia spoločnosť EMI im ponúkla zmluvu. Začala sa tak éra Red Hot Chili Peppers.

Avšak, hneď po podpísaní zmluvy na album sa Hillel a Jack rozhodli kapelu opustiť a venovať sa vlastnému projektu s názvom What Is This? Nahradili ich Jack Sherman a Cliff Martinez. Táto zmena spôsobila stratu fluida, novonahraný album bol podľa mnohých zlý. Volal sa Red Hot Chili Peppers a chýbalo mu to, čo fanúšikov priťahovalo na predošlých live koncertoch. Navyše Jack Sherman sa začal dostávať do konfliktov s členmi kapely, čo vyvrcholilo jeho odchodom. Na jeho miesto sa vrátil Hillel Slovak.

Neúspech prvého albumu kapelu neodradil. Predošlého producenta nahradil George Clinton (spevák kapely Parliament Funkadelic). CD s názvom Freaky Styley bol síce lepší, no stále nie veľmi úspešný. Spôsobili to najmä kritici, ktorým sa nepozdávalo spojenie bielych hudobníkov hrajúcich rap a funk. Iba v Európe sa do povedomia dostal singel Hollywood (Africa), následne kapelu opustil ďalší člen, Martinez. Na začiatku roku 1986 sa na jeho miesto vrátil Jack Irons.

Návrat Jacka Ironsa kapelu popohnal ďalej, v roku 1987 vydali ďalší album The Uplift Mofo Party Plan, ktorý produkoval Michael Beinhorn. Tento album je jediný natočený pôvodnými členmi kapely. Možno práve preto bol aj prvým, ktorý vstúpil do rebríčka Billboard Top 200, na 147. miesto. Z albumu najviac rozvírili rádiové vlny piesne Fight Like a Brave a Behind the Sun.

V nádeji, že svitá na úspešné časy, kapelu postihol ďalší problém – drogy. Tie boli v kapele prítomné už od založenia, no najmä Hillela zasiahli svojou najväčšou mocou. Pravidelne zdrogovaný podával na koncertoch mizerné výkony, a tak sa ho kolegovia rozhodli poslať na detoxikačnú kúru. Po nej sa veci zdali byť v poriadku, až do 27. júna 1988, keď Hillela našli v jeho byte predávkovaného heroínom.

Smrť Hillela spôsobila odchod Jacka Ironsa, ktorý sa so stratou priateľa nevedel zmieriť. Anthony a Flea však kapele ostali verní a dočasne najali Duana “Blackbyrd” McKnighta (gitara) a D.H.Peligra (bicie). V tomto zložení kapela vydržala do roku 1988. Potom sa ku gitare postavil iba 18-ročný John Frusciante, k bicím sa posadil Chad Smith, ktorý vyhral konkurz vyhlásený kapelou.

V novom zložení kapela nahrala album Mother's Milk, ktorý vyšiel v roku 1989. Vďaka piesňam Higher Ground a Knock Me Down sa stal úspešným aj v Európe. Album je zmesou funku, rapu, metalu a jazzu a je venovaný pamiatke Hillela. Po platni nasledovalo 9 mesačné turné po USA a Európe.

V roku 1990 Red Hot opustilo vydavateľstvo EMI a podpísalo zmluvu s Warner Bros. Records. S producentom Rickom Rubinom nahrali dovtedy najúspešnejší album, Blood Sugar Sex Magik. Ten vyšiel v roku 1991 a obsahoval hity ako Give It Away (prvý singel, ktorý sa dostal na 1. miesta v rebríčkoch) alebo Under the Bridge. Mnohými je považovaný za najlepší rockový album 90. rokov.

Tak sa Red Hot konečne dostali na vrchol, spolukoncertovali so skupinami ako Nirvana, Pearl Jam alebo Smashing Pumpkins. Avšak mladučký John Frusciante nezvládol rapídny nával slávy a rozhodol sa kapelu opustiť. Bolo to v máji 1992, počas turné v Tokyu. Chvíľu nato sa John dal na drogy – heroín a kokaín.

V roku 1995 skupina nahrala album One Hot Minute, na ktorom si namiesto Johna zahral Dave Navarro. Dave však podľa kritikov nekorešpondoval so štýlom ostatných členov kapely, rozdiely boli veľmi značné, kapela vraj Fruscianteho odchodom veľa utrpela. Okrem iného, album One Hot Minute prekvapil svojou čiernotou a zmiešaním rôznych iných štýlov, najmä heavy metalom. Kritici však fanúšikov neodradili, z albumu sa predali 4 milióny kópií. Známe sú single Aeroplane, My Friends. Love Rollercoaster, cover verzia od Ohio Players bola nahratá ako soundtrack k filmu Beavis and Butt-Head a zožala tiež veľký úspech, hoci sa na albume One Hot Minute nenachádza.

Nasledujúce roky boli poznačené ďalšími drogovými problémami, tentoraz u Kiedisa a Navarra. Navarro nakoniec v roku 1998 skupinu opustil, aby sa mohol venovať svojim vlastným hudobným projektom.

Bol to asi zázrak, keď sa John Frusciante navrátil ku kapele. Jeho sólová kariéra, počas ktorej nahral 2 albumy, bola divoká a skončila sa povinnou detoxikačnou kúrou. Po nej sa so znovu objaveným elánom pridal k starým kolegom. Spoločne v roku 1999 vydali skvelý album Californication. Toto CD vyhlásilo návrat slávnej kapely a jej nezameniteľného hudobného štýlu, ku ktorému prispel práve John Frusciante. Na albume nachádzame megahity ako Scar Tissue, Californication či Otherside, vďaka ktorým sa ho predalo 15 miliónov kópií po celom svete. Nasledujúce 2 roky boli v znamení tohoto albumu a Red Hot odohrávali svoje najväčšie koncerty. Pamätným je koncert na Červenom námestí v Moskve, ktorý videlo 200 000 osôb. V roku 2001 vyšlo prvé live DVD – Off the Map.

Aj ďalší štúdiový album, By the Way, vydaný v roku 2002, zožal obrovský úspech, hoci mnohých prekvapil jemnejší rytmus. Štýl funk zmizol a piesne sú ladené popovo. Tu nachádzame single By the Way, Can't Stop a The Zephyr Song.

Tak ako po vydaní albumu Californication, tak aj po vydaní By the Way sa kapela na dva roky vybrala na turné, pričom vydala druhé live DVD a nahrala nejaké nové piesne pre nasledujúci Greatest Hits album.

Šiesteho októbra 2002, frontman kapely, Anthony Kiedis vydal autobiografiu, Scar Tissue, v ktorej vylíčil detaily o svojich priateľoch, láskach, o problémoch s drogami a o svojej vášni k hudbe.

Zatiaľ posledný album, Stadium Arcadium, vydaný v máji 2006, sa navracia k štýlu funk. Je to vlastne prvý dvojalbum skupiny, 3. vydaný v rovnakom zložení hudobníkov. Poznáme z neho napríklad single Dani California a Snow (Hey Oh).